DETECCIÓN DE HELICOBACTER PYLORI POR PCR DEL GEN 16S EN BIOPSIAS GÁSTRICAS COLECTADAS EN LA CIUDAD DE BOGOTÁ: ESTUDIO PRELIMINAR
Palabras clave:
Helicobacter pylori, biopsias, PCR, 16S, biopsies, 16S.Resumen
Helicobacter pylori es una bacteria relacionada con diferentes enfermedades digestivas que afecta a un número significativo de individuos en la población Colombiana. Si bien se dispone de diferentes técnicas de diagnóstico para este patógeno, los procedimientos microbiológicos e histológicos utilizados rutinariamente requieren de varios días para generar resultados. Actualmente las técnicas de biología molecular muestran resultados favorables para la identificación de patógenos debido a que cada vez son menos costosas y los resultados se obtienen en menor tiempo en comparación con los procedimientos convencionales. En el presente estudio evaluamos la técnica de PCR de un fragmento del gen DNAr 16S para determinar la presencia de H. pylori en biopsias gástricas de pacientes que asistieron a consulta en dos Instituciones de salud en Bogotá. En 23 de 69 muestras evaluadas se identificó la presencia de H. pylori. La metodología evaluada mostró ser pertinente y sencilla como protocolo de referencia para la detección rápida de este microorganismo en biopsias gástricas.
DETECTION OF HELICOBACTER PYLORI BY 16S RDNA PCR IN GASTRIC BIOPSIES COLLECTED IN BOGOTA: A PRELIMINARY STUDY
ABSTRACT
Helicobacter pylori is a bacterium related to different digestive diseases that affects a significant number of individuals in the Colombian population. Although it has different diagnostic techniques for this pathogen, frequently used microbiological and histological procedures require several days to generate results. Currently the techniques of molecular biology show favorable results for the identification of pathogens because fewer costly and results are obtained in less time compared to conventional methods. In the present study we evaluated PCR of 16S rDNA gene fragment for the presence of H. pylori in gastric biopsies of patients attending consultation on two health institutions in Bogotá. In 23 of 69 samples tested H. pylori was identified. The methodology proved to be evaluated as a easy and relevant protocol for the fast detection of this organism in gastric biopsies.
Biografía del autor/a
Sebastián Rojas-Lara, Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.A
Estudiante Medicina, Joven investigador, Grupo de Investigación en Ciencias Biomédicas y Genética Humana Aplicada GIBGA.
Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.A., Bogotá.
Carlos Eduardo Barragán, Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.A
Martín Alonso Bayona-Rojas, Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.A
Bacteriólogo, Esp., M.Sc. Grupo de Investigación en Ciencias Biomédicas y Genética Humana Aplicada GIBGA. Universidad de
Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.A.
Ricardo Oliveros, Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.A
Médico, Gastroenterólogo. Grupo de Investigación en Ciencias Biomédicas y Genética Humana Aplicada GIBGA. Universidad de
Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.A.
Andrés Julián Gutiérrez-Escobar, Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.A
Lic. Biología, M.Sc. Líder Grupo de Investigación en Ciencias Biomédicas y Genética Humana Aplicada GIBGA. Universidad de
Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.A Bogotá, Colombia.
Referencias bibliográficas
Marshall B.; Warren, J. Unidentifed curved bacilli in the stomach of patients with gastritis and peptic ulceration. Lancet.1984; 1: 1311-5.
Ishihara, S.; Fukuda, R.; Fukumoto, S. Cytokine gene expression in gastric mucosa: its role in chronic gastritis. J Gastroenterol.1996; 31:485-90.
WHO, International Agency for research on cancer. IARC monographs on the evaluation of the carcinogenic risks to humans: Schistosomes, liver flukes and Helicobacterpylori. In: WHO, International Agency for research on cancer. Infection with Helicobacter pylori. Lyon: International Agency for Research on cancer; 1994. p. 177-241.
International Agency for research on Cancer.Schistosomes, liver flukes and Helicobacter pylori.IARC Monographs on the Evaluation of carcinogenics risks to humans. Vol. 61. Lyon: IARC 1994.
Arismendi, G.; Hernández, I.; Mengual, E.; Abreu, N.; Molero, N.; Fuenmayor, A.; Lizarzábal, M. Esti- mación de riesgo de cáncer gástrico en pacientes con gastritis crónica asociada a la infección por Helicobacter pylori en un escenario clínico. Rev Gastroenterol Mex. 2013: 78(03): 135-43.
Ortega, J.; Espinosa, A.; Calvo, A.; Verdugo, P.; Pruyas, M.; Nilsen, E.;Villarroel, L.; Pandilla, O.; Riquelme, A.; Rollan, A. Helicobacter pylori infection in symptomatic patients with benign gastroduodenal diseases. Analysis of 5.664 cases. Rev Med Chile:
; 138: 529-535.
Coelho, L.; Leon, R.; Quigley, E. Latin-American consensus conference on Helicobacter pylori infection. Am J Gastroenterology. 2000; 95:2688-91.
Cisneros, S. Mecanismos de resistencia de Helicobacter pylori a los antibióticos amoxicilina, claritromicina, levofloxacina y metronidazol. [Trabajo de grado]. Bogotá D.C: Facultad de Ciencias, Pontificia Universidad Javeriana; 2009.
Figueroa, M.; Cortés, A.; Pazos, Á. & Bravo, L. Susceptibilidad in vitro de Helicobacter pylori a amoxicilina y claritromicina obtenido a partir de biopsias gástricas de pacientes de zona de bajo riesgo para cáncer gástrico. Biomédica.2012; 32(1) Recuperado de http://www.redalyc.org/articulo. oa?id=84322454004
Bravo, L.; Cortés, A.; Carrascal, E.; Jaramillo, R., García, L.; Bravo, P.; Badel, A.; Bravo, P. Helicobacter pylori: patología y prevalencia en biopsias gástricas en Colombia. Corporación Editora Médica del Valle: Revista Colombia Médica.2003; 34(3).
Martínez, J.; Henao, S.; Granados, C. (2007).
La gastritis crónica atrófica corporal y la edad. Rev Col Gastroenterol [serial on the Internet]. [Ci- ted 2014 Oct 06]; 22(1): 17-22. Available from: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_ arttext&pid=S0120-99572007000100005&lng=en.
Li, Z.;Zou, D.; Ma, X.; Chen, J.; Shi, X.; He, J. et al. Epidemiology of peptic ulcer disease: endoscopic results of the systematic investigation of gastrointestinal disease in China. The American Journal of Gastroenterology [serial on the Internet]. (2010, Dec), [cited August 20, 2012]; 105(12): 2570-2577. Available from: MEDLINE Complete.
McColl, Kenneth EL. “Helicobacter pylori infection.” New England Journal of Medicine 362.17 (2010): 1597-1604.
Rodicio, M.; Mendoza, M. Identification of bacteria through 16S rRNA sequencing: Principles, methods and applications in clinical microbiology. Departa- mento de Biología Funcional. Área de Microbiología. Universidad de Oviedo. España, EnfermInfeccMicro- biolClin 2004; 22(4):238-45.
Chen, T., Meng, X., Zhang, H., Tsang, R. W., & Tsang, T. K. Comparing multiplex PCR and rapid urease test in the detection of H. pylori in patients on proton pump inhibitors. Gastroenterology research and practice, 2012.
He, Q.; Wang, J.; Osato, M.; Lachman, L. Real-time quantitative PCR for detection of Helicobacter pylori. J ClinMicrobiol. 2002; 40(10): 3720-3728.
Yantiss, R.;Odze, R. Optimal Approach to Obtaining Mucosal Biopsies for Assessment of Inflammatory Disorders of the Gastrointestinal Tract.AJG. 2009; 104:774–783.
Bayona, M. Condiciones microbiológicas para el cultivo de Helicobacter pylori. Rev Col Gastroenterol. 2013; 28 (2).
Duś, I.;Dobosz, T.; Manzin, A.; Loi, G.; Serra, C., & Radwan-Oczko, M. Role of PCR in Helicobacter pylori diagnostics and research--new approaches for study of coccoid and spiral forms of the bacteria. PostepyHig Med Dosw (Online).2013; 67: 261-268.
Vinette, K.; Gibney, K.; Proujansky, R.; Fawcett P. Comparison of PCR and clinical laboratory tests for diagnosing Helicobacter pylori infection in pediatric patients. BMC Microbiology, 2004; 4:5.Published online Jan 27,2004. doi: 10.1186/1471-2180-4-5
Monstein, H.; Nikpour, B.; Jonasson, J. Rapid molecu- lar identification and subtyping of Helicobacter pylori by pyrosequencing of the 16S rDNA variable V1 and V3 regions. FEMS Microbiology Letters.2001; 199: 103– 107. doi: 10.1111/j.1574-6968.2001.tb10658.x
Scaletsky, I.; Aranda, K.;García, G.; Goncalves, M.; Cardoso, S.; Iriya, K. & Silva, N. Application of real-Time PCR Stool Assay for Helicobacter pylori Detection and Clarithromycin Susceptibility Testing in Brazilian Children. Helicobacter. 2011; 16(4):311-315.
Ramírez, M.; Lario, S.; Casalots, A.; Sanfeliu, E.; Boix, L., Garcia, P.; Sánchez, J.; Monserrat, A. et al.Real-time PCR improves Helicobacter pylori detec- tion in patients with peptic ulcer bleeding. PloSone. 2011; 6(5):1-7.
Moncayo, J.; Santacruz, J.; Álvarez, A.; Franco, B.; López, M.; Ángel, A., & Serrano, H. Comparación de métodos diagnósticos en la infección por Helicobacter pylori en Quindío, Colombia.2013.
Lehours, P.; Siffré, E.;Mégraud, F. DPO multiplex PCR as analternativeto culture and susceptibilitytes- tingtodetectHelicobacter pylori and its resistance to clarithromycin. BMC Gastroenterology.2011; 11(112).
Chattopadhyay, S.; Patra, R.; Ramamurthy, T.; Chowdhury, A.; Santra, A.; Dahli,G.; Bhattacharya, S.; Berg, D.; Nair, G.; Mukhopadhyay AK. Multiplex PCR assay for rapid detection and genotyping of Helicobacter pylori directly from biopsy specimens. J ClinMicrobiol. 2004; 42(6):2821- 2824.
Belda, S.; Sáez, J.; Santibáñez, M.; Rodríguez, J.; Galiana, A.; Sola-Vera,ggJ.; Montserrat Ruiz-García, M.et al. Quantification of Helicobacter pylori in gastric mucosa by real-time polymerase chain reaction: comparison with traditional diagnostic methods.” Diagnostic microbiology and infectious disease. 2012; 74(3): 248-252.
Smith, S.; Fowora, M.; Otegbayo, J.; Abdulkareem, F.; Omonigbehin, E.; Adegboyega, A.; Contreras, M.; Haas, R. Comparison of PCR with other diagnostic techniques for the detection of Helicobacter pylori infection in patients presenting with gastroduodenal symptons in Nigeria. Int J MolEpidemiol Genet 2011; 2(2):178-184.
Patel, S. K., Pratap, C. B., Jain, A. K., Gulati, A. K., & Nath, G. Diagnosis of Helicobacter pylori: What should be the gold standard? World journal of gas- troenterology: WJG 2014, 20(36), 12847.
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